Ключевые слова
Как цитировать
Аннотация
Ювенильный идиопатический артрит (ЮИА) представляет собой гетерогенную группу хронических воспалительных заболеваний суставов у детей в возрасте до 16 лет, которые часто приводят к инвалидизации, задержке роста и системным осложнениям. Достижение клинической ремиссии на фоне медикаментозной терапии является ключевой целью лечения ЮИА. Однако транскриптомные данные свидетельствуют о том, что лекарственно-индуцированная ремиссия может не означать восстановления иммунологической нормы, что обуславливает необходимость поиска биомаркеров для идентификации этого состояния и прогнозирования долгосрочной стабильности. Цель исследования – идентифицировать гены-концентраторы и сигнальные пути, характеризующие персистирующий иммунный дисбаланс в транскриптоме гранулоцитов у пациентов с полиартикулярным ЮИА в состоянии ремиссии при медикаментозном лечении. Для этого были проанализированы транскриптомные данные гранулоцитов (GSE41831) пациентов с полиартикулярным ЮИА, достигших ремиссии на фоне комбинированной терапии (метотрексат и этанерцепт), и здоровых детей. Дифференциально экспрессируемые гены (DEG) были идентифицированы с помощью инструмента GEO2R с пороговыми значениями скорректированного p-уровня < 0,05 и |Log FC| ≥ 0,5. Анализ функционального обогащения был выполнен в платформе Enrісhr с использованием баз данных Gene Ontology (GO), Kyoto Enсуclopediа of Genes аnd Genomes (KEGG) и Reаctome. Сеть белок-белковых взаимодействий (PPI) была построена с помощью базы данных STRING и визуализирована в программе Суtoscаpe. Гены-концентраторы идентифицировали с помощью плагина СуtoHubbа, используя алгоритм максимальной кликовой центральности (MCC). Экспрессия ведущих генов-концентраторов была статистически подтверждена. Из 54 675 проанализированных генов было идентифицировано 232 DEG, из которых 99 обладали пониженной и 133 – повышенной экспрессией. Анализ функционального обогащения позволил выделить две основные функциональные категории: реорганизация актинового цитоскелета и дерегуляция метаболизма аминокислот наряду с провоспалительным сигналингом. Данные процессы соответствуют активированному состоянию гранулоцитов, что указывает на персистирующую клеточную активность даже в состоянии клинической ремиссии. Сеть PPI включала 126 узлов и 498 ребер. С помощью алгоритма MCC были идентифицированы 10 генов-концентраторов, среди которых наиболее значимыми оказались HSP90АB1 и HSP90АА1, что позволяет предположить их роль в качестве ключевых регуляторов наблюдаемого молекулярного дисбаланса. Несмотря на достижение клинической ремиссии, у пациентов с полиартикулярным ЮИА в гранулоцитах сохраняется персистирующий активированный транскриптомный профиль. Повышенная экспрессия генов HSP90АB1 и HSP90АА1 свидетельствует о сохраняющемся клеточном стрессе и позволяет рассматривать эти гены в качестве кандидатных биомаркеров субклинического иммунного дисбаланса и потенциальных терапевтических мишеней для достижения более глубокой ремиссии. Полученные результаты закладывают основу для дальнейших исследований, направленных на трансляцию фундаментальных открытий в клиническую практику.